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ELISA试剂确定了18个驱动*侵袭性的成人脑癌基因

点击次数:577 更新时间:2015-06-03

ELISA试剂研究发布在8月5日的《自然遗传学》(Nature Genetics)杂志上。

论文的主要作者、哥伦比亚大学医学中心病理学和神经病学教授Antonio Iavarone博士说:“癌症依赖于驱动基因(driver genes)来维持癌症,这些驱动基因是治疗的靶点。"

“一旦你知道一种特定肿瘤的驱动子,你击中它,癌症就会崩溃。我们认为我们的研究已经取得了胶质母细胞瘤中绝大多数的驱动基因,因此为胶质母细胞瘤药物开发提供了zui重要的靶点列表,并为脑癌个体化治疗奠定了基础。"


哥伦比亚大学医学中心儿科学和病理学与细胞生物学副教授Anna Lasorella博士说,对于大约15%的胶质母细胞瘤患者,个体化治疗有可能会很快成为现实。


她说:“新研究显示大约15%的胶质母细胞瘤它们的驱动基因,都可以用目前FDA批准可获得的药物靶向。不知道为什么这些患者在当前的临床试验中没有接受这些药物治疗。"


新生物信息学技术将驱动基因与其他的突变区分开来


在所有单个肿瘤中,可能有成百上千的基因发生了突变,但将驱动癌症的突变与没有影响的突变区分开来对研究人员而言是一个长期存在的挑战。

该研究小组结合高通量DNA测序与一种统计分析新方法,生成了一个驱动候选基因短名单。大规模分析近140个脑瘤,测序肿瘤中每个基因的DNA和RNA,鉴别出了每个肿瘤的所有突变。共同作者、生物医学信息学和系统生物学助理教授Raul Rabadan博士设计出一种统计算法,随后被用于鉴别zui有可能的驱动突变。不同于其他的技术,这一算法不仅考虑到了不同肿瘤中基因的突变频率,还纳入了突变方式,由此将驱动突变与其他的突变区分开来。


Iavarone博士说:“如果肿瘤中基因的一个副本在一个单位点突变,第二个副本以另一种不同方式突变,那么这个基因就有较高的概率是驱动基因。"


分析确定了15个以往在其他研究中证实的驱动基因,还发现了18个从未显示与胶质母细胞相关的新驱动基因。

值得注意的是,在18个新基因中有一些zui重要的候选基因,例如LZTR1和delta catenin,在来自人类肿瘤的癌症干细胞实验室研究、细胞培养物检测以及移植小鼠研究中均被证实是驱动基因。

 

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